Về mặt pháp lý, công ty được phép trừ tiền tàu xe của những ngày nghỉ phép có lương vào trợ cấp đi lại. Tuy nhiên, công ty cần quy định rõ ràng điều này trong Nội quy lao động (就業規則-shuugyou kisoku) của công ty từ trước.

　Luật pháp không bắt buộc doanh nghiệp phải trả trợ cấp đi lại. Do đó, việc chi trả trợ cấp đi lại sẽ dựa trên quy định trong nội quy lao động.

　Nếu bạn muốn chỉ chi trả chi phí đi lại thực tế cho những ngày nhân viên đi làm, bạn có thể thêm vào nội quy lao động những quy định như sau:
【Ví dụ】
　　　・Trợ cấp đi lại sẽ được trả dựa trên số ngày làm việc thực tế của nhân viên.
　　　・Không trả trợ cấp đi lại cho những ngày nhân viên nghỉ phép có lương.