通常、以下の内容が確認されます。
・労働時間管理、給与計算（残業代未払い）
・有給取得状況
・就業規則等の適法性
・健康診断受診状況
・機械の点検記録
・機械操作を行っている社員の有資格者確認　等

違反が発覚したときは、監督署は企業に対し指導または是正勧告を行います。 指導または是正勧告を受けたときは、指定された日までに、改善を行い労働基準監督署へ報告をします。

主な必要書類は下記です。
・出勤簿またはタイムカード
・賃金台帳
・労働者名簿
・36協定書、変形労働制の協定書
・就業規則、賃金規程、諸規定
・雇用契約書または労働条件通知書
・有給休暇管理簿
・資格保有者一覧表
・健康診断受診記録